Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PAK1IP1Q9NWT1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PAK1IP1Q9NWT1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms