Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM248Q9NWD8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM248Q9NWD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM248Q9NWD8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms