Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FANCLQ9NW38 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FANCLQ9NW38 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FANCLQ9NW38 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms