Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RLIMQ9NVW2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RLIMQ9NVW2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RLIMQ9NVW2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms