Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KLHL11Q9NVR0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KLHL11Q9NVR0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL11Q9NVR0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms