Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MED17Q9NVC6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MED17Q9NVC6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED17Q9NVC6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms