Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM140Q9NV12 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM140Q9NV12 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM140Q9NV12 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms