Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
LTBP3Q9NS15 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
LTBP3Q9NS15 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LTBP3Q9NS15 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LTBP3Q9NS15 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
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