Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLE3Q9NRF9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLE3Q9NRF9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
POLE3Q9NRF9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms