Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FBXO6Q9NRD1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FBXO6Q9NRD1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FBXO6Q9NRD1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms