Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARHGEF3Q9NR81 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARHGEF3Q9NR81 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARHGEF3Q9NR81 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARHGEF3Q9NR81 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms