Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW5

PRDM7, Probable histone-lysine N-methyltransferase PRDM7, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM7Q9NQW5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRDM7Q9NQW5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRDM7Q9NQW5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRDM7Q9NQW5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms