Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
INCENPQ9NQS7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
INCENPQ9NQS7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
INCENPQ9NQS7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
INCENPQ9NQS7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms