Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NRIP3Q9NQ35 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NRIP3Q9NQ35 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms