Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ34

TMEM9B, Transmembrane protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9BQ9NQ34 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMEM9BQ9NQ34 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM9BQ9NQ34 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9BQ9NQ34 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms