Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
A4GALTQ9NPC4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
A4GALTQ9NPC4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
A4GALTQ9NPC4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms