Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP84

TNFRSF12A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 12A, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF12AQ9NP84 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TNFRSF12AQ9NP84 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TNFRSF12AQ9NP84 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TNFRSF12AQ9NP84 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms