Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM60AQ9NP50 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM60AQ9NP50 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM60AQ9NP50 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM60AQ9NP50 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms