Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BRMS1Q9HCU9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
BRMS1Q9HCU9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
BRMS1Q9HCU9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
BRMS1Q9HCU9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms