Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POPDC2Q9HBU9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POPDC2Q9HBU9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POPDC2Q9HBU9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POPDC2Q9HBU9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms