Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CLSPNQ9HAW4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC35■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
CLSPNQ9HAW4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CLSPNQ9HAW4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.82■■■■□ 3.17
CLSPNQ9HAW4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms