Protein–RNA interactions for Protein: Q9H902

REEP1, Receptor expression-enhancing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP1Q9H902 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
REEP1Q9H902 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
REEP1Q9H902 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms