Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SYNCQ9H7C4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SYNCQ9H7C4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SYNCQ9H7C4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms