Protein–RNA interactions for Protein: Q9H714

RUBCNL, Protein RUBCNL-like, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUBCNLQ9H714 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RUBCNLQ9H714 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RUBCNLQ9H714 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RUBCNLQ9H714 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RUBCNLQ9H714 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms