Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX17Q9H6I2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
SOX17Q9H6I2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SOX17Q9H6I2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 444 ms