Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP4Q9H6H4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP4Q9H6H4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms