Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC86Q9H6F5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC86Q9H6F5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC86Q9H6F5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC86Q9H6F5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134 ms