Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FNDC4Q9H6D8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FNDC4Q9H6D8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FNDC4Q9H6D8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FNDC4Q9H6D8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FNDC4Q9H6D8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FNDC4Q9H6D8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms