Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
SENP3Q9H4L4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
SENP3Q9H4L4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SENP3Q9H4L4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SENP3Q9H4L4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms