Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRN3Q9H3W5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LRRN3Q9H3W5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms