Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S1

SEMA4A, Semaphorin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4AQ9H3S1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEMA4AQ9H3S1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEMA4AQ9H3S1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA4AQ9H3S1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4AQ9H3S1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4AQ9H3S1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA4AQ9H3S1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms