Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3Q1

CDC42EP4, Cdc42 effector protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP4Q9H3Q1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDC42EP4Q9H3Q1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDC42EP4Q9H3Q1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDC42EP4Q9H3Q1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms