Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PARLQ9H300 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PARLQ9H300 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PARLQ9H300 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PARLQ9H300 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PARLQ9H300 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PARLQ9H300 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PARLQ9H300 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PARLQ9H300 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PARLQ9H300 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PARLQ9H300 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PARLQ9H300 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms