Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L4

TMEM60, Transmembrane protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM60Q9H2L4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM60Q9H2L4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM60Q9H2L4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TMEM60Q9H2L4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM60Q9H2L4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms