Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MED28Q9H204 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MED28Q9H204 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms