Protein–RNA interactions for Protein: Q9H195

MUC3B, Mucin-3B (Fragments), humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3BQ9H195 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MUC3BQ9H195 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MUC3BQ9H195 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MUC3BQ9H195 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms