Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E3

SAP130, Histone deacetylase complex subunit SAP130, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP130Q9H0E3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SAP130Q9H0E3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SAP130Q9H0E3 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SAP130Q9H0E3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SAP130Q9H0E3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SAP130Q9H0E3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAP130Q9H0E3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SAP130Q9H0E3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SAP130Q9H0E3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAP130Q9H0E3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SAP130Q9H0E3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms