Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TGIF2Q9GZN2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TGIF2Q9GZN2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms