Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM4Q9C037 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM4Q9C037 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRIM4Q9C037 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM4Q9C037 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM4Q9C037 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM4Q9C037 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM4Q9C037 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM4Q9C037 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM4Q9C037 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRIM4Q9C037 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM4Q9C037 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRIM4Q9C037 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM4Q9C037 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM4Q9C037 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM4Q9C037 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms