Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
GABARAPL3Q9BY60 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
GABARAPL3Q9BY60 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms