Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MS4A8Q9BY19 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MS4A8Q9BY19 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MS4A8Q9BY19 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms