Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB11FIP5Q9BXF6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms