Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM106CQ9BVX2 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM106CQ9BVX2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM106CQ9BVX2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms