Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PBDC1Q9BVG4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PBDC1Q9BVG4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PBDC1Q9BVG4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms