Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBB2BQ9BVA1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBB2BQ9BVA1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBB2BQ9BVA1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms