Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNPPD1Q9BV87 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNPPD1Q9BV87 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNPPD1Q9BV87 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms