Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EFHD1Q9BUP0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFHD1Q9BUP0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFHD1Q9BUP0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFHD1Q9BUP0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms