Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD7Q9BUK0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD7Q9BUK0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms