Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
COPS4Q9BT78 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
COPS4Q9BT78 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COPS4Q9BT78 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms