Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CHCHD5Q9BSY4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CHCHD5Q9BSY4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms